Helsingin seurakuntayhtymä (ruots.Helsingfors kyrkliga samfällighet, brändinimeltään Kirkko Helsingissä) on Helsingin alueen evankelis-luterilaisten seurakuntien muodostama yhtymä, johon kuuluu 16 suomenkielistä ja kolme ruotsinkielistä seurakuntaa.[3] Helsingissä sijaitsevat ja valtakunnallisesti toimivat Olaus Petri församling ja Suomen saksalainen seurakunta eivät kuulu Helsingin seurakuntayhtymään.
Seurakuntayhtymän toimipaikka Seurakuntien talo sijaitsee Kalliossa Kolmannella linjalla ja siellä sijaitsevat mm. keskusrekisteri, hallinto- ja taloustoimisto, viestintä, kiinteistötoimisto ja yhteinen seurakuntatyö.
Vuoden 2024 syyskuussa Helsingin seurakuntayhtymän seurakunnilla oli yhteensä 309 923 jäsentä[1], mikä vastasi noin 45,4 prosenttia helsinkiläisistä[2]. Sekä jäsenosuus että jäsenten määrä ovat olleet viime vuosina selvässä laskussa.[4]
Johannes församling (perustettiin 2009 yhdistämällä Meilahdessa ja Töölössä toiminut Tomas församling, Keski-Helsingissä toiminut Norra svenska församlingen ja Etelä-Helsingissä sekä Lauttasaaressa toiminut Södra svenska församlingen)