Helsingin seurakuntayhtymä (ruots.Helsingfors kyrkliga samfällighet, brändinimeltään Kirkko Helsingissä) on Helsingin alueen evankelis-luterilaisten seurakuntien muodostama yhtymä, johon kuuluu 17 suomenkielistä ja kolme ruotsinkielistä seurakuntaa.[2] Helsingissä sijaitsevat ja valtakunnallisesti toimivat Olaus Petri församling ja Suomen saksalainen seurakunta eivät kuulu Helsingin seurakuntayhtymään.
Seurakuntayhtymän toimipaikka Seurakuntien talo sijaitsee Kalliossa Kolmannella linjalla ja siellä sijaitsevat mm. keskusrekisteri, hallinto- ja taloustoimisto, viestintä, kiinteistötoimisto ja yhteinen seurakuntatyö.
Vuodenvaihteessa 2022 – 2023 helsinkiläisistä 47,4 prosenttia kuului Suomen evankelis-luterilaiseen kirkkoon. Helsingin seurakuntayhtymän jäsenmäärä oli tuolloin 315 446 jäsentä.[1]
Johannes församling (perustettiin 2009 yhdistämällä Meilahdessa ja Töölössä toiminut Tomas församling, Keski-Helsingissä toiminut Norra svenska församlingen ja Etelä-Helsingissä sekä Lauttasaaressa toiminut Södra svenska församlingen)