Runkosarjassa pelattiin 24 kierrosta, jonka jälkeen kahdeksan parasta joukkuetta selvityivät jatkosarjaan. Se pelattiin yksinkertaisena sarjana, joten joukkueille kertyi jatkosarjassa seitsemän ottelua.
Runkosarjan kuudelle parhaalle jaettiin jatkosarjaan hyvityspisteet kaavan 5–4–3–2–1–1 mukaisesti.
Jatkosarjan neljä parasta joukkuetta selviytyivät välieriin, jotka pelattiin paras viidestä -järjestelmällä.
Välierien voittajat kohtasivat niin ikään paras viidestä -järjestelmällä pelattavassa loppuottelussa. Pronssiottelu pelattiin paras kolmesta -järjestelmällä.
Runkosarjan kaksi huonointa joutuivat karsimaan sarjapaikastaan Ykköspesiksen kahden parhaan joukkueen kanssa. Superpesiksen 11:nneksi sijoittunut kohtasi Ykköspesiksen hopeajoukkueen ja Ykköspesiksen mestari puolestaan Superpesiksessä viimeiseksi jääneen. Ottelusarjat pelattiin paras viidestä -järjestelmällä, ja niiden voittajat lunastivat itselleen Superpesis-paikan kaudelle 2009.