Prätkähiirten 3. tuotantokausi alkoi Yhdysvalloissa23. syyskuuta1995 jaksolla Biker Knights of the Round Table, Part 1, joka tunnetaan Suomessa nimellä Pyöreän pöydän prätkäritarit, Osa 1. 3. kausi käsittää kolmetoista jaksoa, jotka kuitenkin esitettiin sekalaisessa järjestyksessä. Yhdysvalloissa kolmannen kauden esitys päättyi 24. helmikuuta1996.
Prätkähiiret täytyy matkata ajassa taaksepäin kuningas Artturin aikakauteen, ja pysäyttää Leipäjuusto varastamasta maata Englannista, sekä tuhoamasta Camelottia.
Prätkähiirten polttoaine on käymässä vähiin ja Camelot on vaarassa, kun Leipäjuusto liittoutuu kuningas Arthurin verivihollisen ja tämän noidan Mona Lisan kanssa.
Plutolainen neuvonantaja Tuomari Huijantalo on matkalla maahan todistamaan Ylipäällikkö Camembertin olevan syyllinen Pluton katoaviin varoihin. Hänen alukseensa tulee kuitenkin konevika, ja se putoaa Monttuun. Tämän myötä Prätkähiiret yrittävät voittaa jälleen kerran Monttupomon, sekä palauttaa lain Monttuun.
Prätkähiiret saavat odottamattomia hyökkäyksiä, kun Pluton suurimmat johtajat saapuvat Chicagoon kilpailemaan siitä kuka pääsee ensimmäisenä eroon Prätkähiiristä.
Leipäjuusto käyttää Nuikin uusinta keksintöä varastaakseen maata Shakespearen näytelmien kuvitteellisista paikoista. Tämän seurauksena näytelmät saavat tuhoisia vahinkoja, ja pian häviävät kokonaan pois. Santulla on kuitenkin töitä saada Prätkähiiret uskomaan, että Shakespearen näytelmien pelastaminen on sen arvoista.
Asvaltti-Jaska palaa Chicagoon kihlattunsa kanssa tapaamaan Santtua. Vierailu kuitenkin muuttuu kehnoksi, kun Jaska ja hänen kyberprätkänsä kaapataan. Samalla Leipäjuusto ja Teuvo Tahko kilpailevat siitä kummalla on paremmat apulaiset.
Miihkali ja Rontti saapuvat maahan ryminällä, kun sillä välin Leipäjuusto kehittää uusinta juonta aivopestä kaikki shampoon avulla. Prätkähiiret saavat kuitenkin mutkia matkaan, kun Rontti tuntuu kadottaneen taistelijan taidot.
Prätkähiiret joutuvat salaperäisesti siirretyksi Pluton kaatopaikalle. Samalle he huomaavat Leipäjuuston kilpailevan ylipäällikön asemasta Camembertiä vastaan.
Leipäjuusto aikoo käyttää vanhaa laitettaan muuntajaa saadakseen maapallon pois kiertoradaltaan kohti Plutoa. Samalla Prätkähiiret muistelevat menneitä sota-aikoja Marsissa.
Leipäjuuston suunnitelma tarkentuu, kun hän on tekemässä Maapallosta Pluton uusinta kuuta. Myös Prätkähiiret kertovat lisää Marsin sodasta, jossa he joutuivat kohtaamaan samanlaisen laitteen, jota Leipäjuusto käyttää parhaillaan.
Prätkähiiret kertovat lopulta hetken, jolloin Moto menetti kätensä, Vinski puolet kasvoistaan ja Turbo silmänsä. He myös kokivat erään petturuuden seurauksena ystävän menetyksen.