Kausi nähtiin ensimmäisen kerran sekalaisessa järjestyksessä Yhdistyneessä kuningaskunnassa ja Suomessa. Vain muutama jakso on tuotantokoodin numeroiden mukaisessa järjestyksessä.
Marsista on vesi loppumassa ja tämän vuoksi heitä uhkaa kato. Heidän ainoa toivo on uudistaja laite, jolla he pystyisivät hankkimaan vettä. Mutta pahat Kissatronit, joita johtaa Karvapallo on käskenyt joukkojaan hyökkäämään marsilaisia hiiriä vastaan saadakseen uudistajan omiin tarkoituksiin.
Rontti altistuu tetra hiilivedyille, minkä seurauksena hänestä tulee hullu "Rontti-rotta". Tilanne pahenee entisestään, kun Palkki onnistuu vangitsemaan hänet New Yorkin kaduilta. Palkki yrittää pakottaa Rontin rakentamaan uuden Uudistajan, jolla ilkeä rakennuttaja voisi laajentaa liiketoimintaansa ja rikastua entisestään.
Rami Palkki on nyt entistä rajumpi! tai sekavampi. Hullun tiedemiehen tohtori Katinkosken rakentama Uudistaja räjähtää Palkin kasvoille, minkä seurauksena hän päätyy vaeltamaan Chicagon kaduille muistinsa menettäneenä. Toimiva Uudistaja on yhä Palkin hallussa, mutta pahaksi onneksi hän ei muista, mitä laite tekee.
Prätkähiiret virittävät moottoripyöristään hurjia suopyöriä auttaakseen mutaan jumiutunutta hiirineitokaista. Mutta onko tämä viehättävä neitokainen harmiton vai voisiko hän olla pahamaineinen kissatronilainen muodonmuuttaja Kataliina Katti, joka yrittää huiputtaa Prätkähiiriä paljastamaan salaisen piilopaikan, jossa Rontti valmistelee Marsin uutta Uudistajaa?
Prätkähiiret houkutellaan Palkin marketin alapuolella sijaitsevaan salaiseen maanalaiseen maailmaan, jossa he kohtaavat kaikkien aikojen kovimpiin pahiksiin lukeutuvan Rystysen sekä koko joukon vanhoja vihollisia.
Palkin serkku Risto on kuullut Palkin käyttävän liiketoimintansa laajentamiseen uudistajaa, jonka vuoksi hän vierailee serkkunsa luona. Myös Rontilla on oma osansa, kun hänen täytyy jälleen pelastaa itsensä joutumasta tetra hiilivetyjen vaikutukseen.
Kenraali Minni vierailee maapallolla ilmoittaakseen Turbolle hänen ylennyksestä. Tämä tarkoittaa sitä, että Turbon pitää palata takaisin Marsiin, jossa hänen paikkansa tulee olemaan ylennyksensä myötä. Prätkähiiret saavat kuitenkin korvaajan Turbon tilalle vapaustaistelijoista, Miihkkalin, mutta kaikki ei kuitenkaan suju suunnitelmien mukaan.
Turbo loukkaantuu taistelussa kissatronilaisia vastaan. Herätessään hän luulee olevansa kuuluisan ja ikivanhan jouluelokuvan hahmo! Muut Prätkähiiret joutuvat tekemään kaikkensa estääkseen Turbon päätymisen kissatronilaisten käsiin ja palauttaakseen johtajansa järjen.
Tohtori Katinkoski on löytänyt professori Nuikin vanhan laitteen, jolla voi matkata minne tahansa ajassa. Prätkähiiret saapuvat paikalle nappaamaan uudistajan, mutta Karvapallo hukkaa vahingossa uudistajan laitteeseen, mikä matkaa kohti tulevaisuuteen, jolloin Prätkähiirten täytyy matkata samaan paikkaan pelastaakseen uudistajan.
Prätkähiiret osallistuvat motocross kilpailuun, jossa heitä odottaa odottamaton vastus. Kuten tavallista Santtu toimii Prätkähiirten mekaanikkona, jotta hiirten pyörät toimivat moitteettomasti siitä huolimatta, että radalla tapahtuu kummia asioita.
Palkki palkkaa erään paikallisen konnan tekemään kivivyöryn Rontin luolaan, jossa on hänen laboratorionsa. Prätkähiirten täytyy pelastaa Rontti ennen kuin Palkki ja kissatronilaiset ehtivät saada selville Rontin viimeisimmät keksinnöt.
Prätkähiiret joutuvat käyttämään autoa moottoripyörien sijaan, kun Palkki ja hänen kätyrinsä varastivat ne. Hiiri kolmikolla on kuitenkin toinen ongelma, vaikka he ovatkin universumin parhaat prätkäkuskit, heitä ei ole kuitenkaan kukaan opettanut ajamaan autoa.
Kissatronien Ylikomentaja on saanut tarpeekseen Karvapallon ja Kattinaattorin saamattomuudesta saada uudistaja heidän käsiinsä maapallolla. Jolloin hän lähettää kaksikon tilalle kolme muotoaan muuttavaa kissatronilaista.
Rontti huomaa Palkin asettaneen viruksen hänen tietokoneensa tiedostoihin, jotka sisältävät kaiken salaisuuden uudistajasta. Rontti siirtää itsensä internetin maailmaan yrittääkseen tuhota viruksen, mutta aika käy vähiin, jolloin Prätkähiiret tulevat apuun.
Palkki juontaa omaa tosi-tv-sarjaa, jossa hän tarjoaa palkintona rahaa kenelle tahansa katsojalle, joka pystyy ottamaan kiinni vapaana olevat rikolliset. Tällä viikolla hänen kohteenaan ovat Prätkähiiret, joiden kiinniottamisesta saa miljoona euroa, jolloin kaíkki Chicagon asukkaat ovat Prätkähiirten perässä.
Palkki käyttää uudistajaansa rakentaakseen arktisella luonnon alueelle huvipuiston. Prätkähiiret yrittävät pysäyttää Palkin suunnitelman, mutta he saavatkin vastaansa maailman huippu motocrossaajat, joiden pysäyttäminen ei ole helppoa.
Prätkähiiret saavat huomata etteivät he ole ainoita, jotka etsivät tetra-hiilivetyjä. He tapaavat älykkäältä ja rauhalliselta vaikuttavan lumimies tyyppisen olennon, jonka perhe on pulassa.
Palkki yrittää päästä eroon rypyistään tohtori Katinkosken kehittämällä nuorennusvoiteella, jonka koe-eläimeksi Vinski joutuu. Moton, Turbon ja Santun on kissatronilaisten aikeiden pysäyttämisen lisäksi huolehdittava vauvaksi muuttuneesta Vinskistä.
Minni on ohjeistamassa sotilaitaan uudistajan lisäosan lähettämisestä Prätkähiirille Maahan, kunnes sotilaiden joukkoon soluttautunut kissatronilaisten vakooja ottaa tämän ja marsilaissotilaat panttivangeiksi.
Prätkähiiret saavat vieraita avaruudesta, kun marsilaiset hiirimerirosvot laskeutuvat Michigan-järven pohjaan. Prätkähiiret päättävät sukeltaa järven pohjalle, myös vettä vihaava Vinski. Sillä välin Rontti jatkaa uudistajan rakentamista, mutta joutuu merirosvojen toimesta häirityksi. Prätkähiirten on jälleen pelastettava päivä vedenalaiselta uhalta.
Äänet
Ensimmäiset hiiret kuussa (First Mice on The Moon)
Kissatronilaiset valtaavat Rontin laboratorion uudistajan toivossa ja Rontti pakenee Prätkähiirten luokse Santun korjaamolle. Kissatronilaiset kuitenkin seuraavat Ronttia ja luovat korjaamon ympärille voimakentän, jotta hän ja Prätkähiiret eivät pääse karkuun. Kissatronilaiset onnistuvat kaappaamaan Rontin avaruuteen ja ovat matkalla kohti Kissatronia. Ehtivätkö Prätkähiiret pelastamaan ystävänsä ennen kuin uudistaja joutuu vääriin käsiin?
Karvapallo yrittää nousta Kissatronin ylipäällikön suosioon, kun tämä hypnotisoi Turbon Ronttiin ja uudistajaan liittyvien salaisten tietojen toivossa. Turbo kuitenkin osoittaa, että on aito Prätkähiiri eikä alistu Karvapallon alaisuuteen helpolla.
Äänet
Olipa kerran Marsissa, osa 1 (Once Upon A Time on Earth, Part 1)
Rontti saa Uudistajan vihdoin valmiiksi, jolloin Prätkähiiret ovat valmiina viemään Uudistajan Marsiin ja pelastamaan planeettansa tuholta. Yllättävä käänne kuitenkin syntyy, kun Rontilla onkin oma ideansa käyttää Uudistajaa.
Prätkähiiret ovat ansassa kuin hiiret entisten plutolaisten verivihollisten vankeina, joiden tavoitteena on valloittaa Chicago. Lisäksi Prätkähiirten huolena on erittäin tärkeä kysymys: Onko Rontti vaihtanut puolta ja siirtynyt uudistaja mukanaan vihollisen puolelle? Sillä välin Minni ja Santtu yrittävät jäljittää Prätkähiiriä, mutta he kohtaavat yllättäen tuntemattoman hiiren Rontin menneisyydestä.
Äänet
Olipa kerran Marsissa, osa 3 (Once Upon A Time on Earth, Part 3)
Prätkähiirillä on pahoja ongelmia, kun Rontti on kaapattu kissatronilaisten johdosta ja uudistaja on jälleen Palkilla sekä kissatronilaisilla. Palkki puolestaan haluaa laajentaa bisnestoimintaansa korvaamalla Maan merkittävimmät päämiehet hänelle uskollisilla apulaisilla. Pystyvätkö Prätkähiiret pelastamaan Rontin ja uudistajan sekä Maan siinä ohessa ennen kuin on liian myöhäistä?
Annin kohtalo selviää, kun hän palaa takaisin kriittisellä hetkellä Rottien kanssa tuhotakseen Mars-planeetan uudistajan ja kristallien avulla. Jakso on toteutettu aikaisemmista jaksoista poiketen rock-musikaalina.
