Plasmidi

Wikipediasta
Siirry navigaatioon Siirry hakuun
Bakteerisolu: 1. kromosomaalinen DNA, 2. plasmideja.
Yleiskuva plasmidista, jossa on antibioottiresistenssigeeni. 1 ja 2: antibioottiresistenssigeenejä, 3: ORI-alue.
Elektronimikroskoopin kuvassa oleva bakteerin DNA ja plasmidi.
Plasmidien erilaisia muotoja elektronimikroskoopin kuvassa.

Plasmidi on kromosomin ulkopuolella solulimassa sijaitseva ja itsenäisesti kahdentuva rengasmainen DNA-molekyyli, jonka sisältämät geenit eivät ole eliölle välttämättömiä.[1][2] Plasmideja on bakteereilla ja hiivoilla.[3] Plasmidien koko on suurimmillaan noin 400 000 emäsparia (bp).[4] Yhdessä solussa voi olla samasta plasmidista 1–500 kopiota.[3][5] Termiä ”plasmidi” käytti ensimmäisenä yhdysvaltalainen molekyylibiologi Joshua Lederberg vuonna 1952.[6][7]

Vaikka plasmidit eivät ole välttämättömiä normaalioloissa elävälle organismille, niistä voi kuitenkin olla etua sen ympäristön muuttuessa. Plasmidit voivat sisältää esimerkiksi antibioottiresistenttejä geenejä tai geenejä, jotka mahdollistavat solun rakennusaineiden syntetisoimisen erilaisista lähtöaineista.[3]

Jokainen plasmidi sisältää ainakin yhden DNA-sekvenssin, jossa on replikaation aloituskohta eli ORI-alue (engl. origin of replication). Tämä mahdollistaa plasmidi-DNA:n kahdentumisen itsenäisesti kromosomaalisesta DNA:sta.[1][3] Suurimmalla osalla bakteereista plasmidit ovat rengasmaisia, mutta myös lineaarisia plasmideja tiedetään.[2]

Plasmideja käytetään hyödyksi geenitekniikassa ja yhdistelmä-DNA-tekniikassa.[8]

Vektorit[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]

Geenitekniikassa käytettyjä plasmideja kutsutaan vektoreiksi.[1] Niitä käytetään kuljettamaan geenejä organismista toiseen ja yleensä ne sisältävät jonkin geenimerkin, jonka avulla voidaan plasmidin sisältävät solut seuloa muista.[2][3] Monissa vektoreissa on myös ns. polylinkkeri tai multikloonauskohta (engl. multiple cloning site, MCS). MCS on lyhyt alue, joka sisältää joitakin yleisesti käytettyjä restriktiokohtia.[8] Tämä mahdollistaa DNA-fragmenttien helpon lisäämisen restriktiokohtaan restriktio- ja ligaasientsyymien avulla.[1]

Lähteet[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]

  • Vuorenpää, Maija: Subkloonaus ja restriktioentsyymianalyysi. Opinnäytetyö. Kuopio: Savonia -ammattikorkeakoulu, 2010. Teoksen verkkoversio (viitattu 08.04.2018).

Viitteet[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]

  1. ↑ a b c d Subkloonaus ja restriktioentsyymianalyysi s. 11
  2. ↑ a b c Plasmidit - taso 2 Solunetti. Viitattu 08.04.2018.
  3. ↑ a b c d e Salo, Helena: Kantajavektorit Internetix. 1997. Viitattu 08.04.2018.
  4. ↑ Principles behind plasmid Principles behind plasmid purifications National Food Institute. Viitattu 08.04.2018.
  5. ↑ O'Hanlon Cohrt, Karen: How to Manipulate Plasmid Copy Number Bitesize Bio. 2017. Viitattu 08.04.2018.
  6. ↑ Porterfield, Andrew: Who Found the First Plasmid? Bitesize Bio. 2017. Viitattu 08.04.2018.
  7. ↑ The Joshua Lederberg Papers: Transduction, Plasmids, and the Foundation of Biotechnology U.S. National Library of Medicine. Viitattu 08.04.2018.
  8. ↑ a b Salo, Helena: Johdanto materiaalit.internetix.fi. 1997. Viitattu 08.04.2018.

Aiheesta muualla[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]

Nukleiinihapot ja niiden rakenneosat
Nukleosidien rakenneosat
Emäkset
Puriinit: Adeniini • Guaniini
Pyrimidiinit: Tymiini • Urasiili • Sytosiini
Sokerit Riboosi • Deoksiriboosi
Nukleiinihappojen rakenneosat
Nukleosidit Adenosiini • Uridiini • Guanosiini • Sytidiini • Deoksiadenosiini • Tymidiini • Deoksiguanosiini • Deoksisytidiini
Nukleotidit AMP • UMP • GMP • CMP • ADP • UDP • GDP • CDP • ATP • UTP • GTP • CTP • cAMP • cADPR • cGMP
Deoksiribonukleotidit dAMP • dUMP • TMP • dGMP • dCMP • dADP • TDP • dGDP • dCDP • dATP • TTP • dGTP • dCTP
Nukleiinihapot
Ribonukleiinihapot RNA • mRNA • tRNA • rRNA • ncRNA • sgRNA • shRNA • siRNA • snRNA • miRNA • snoRNA • LNA
Deoksiribonukleiinihapot DNA • mtDNA • cDNA • plasmidi • kosmidi • BAC • YAC • HAC
Nukleiinihappojen analogit GNA • PNA • TNA • morpholino
Tämä biologiaan liittyvä artikkeli on tynkä. Voit auttaa Wikipediaa laajentamalla artikkelia.
Noudettu kohteesta ”https://fi.wikipedia.org/w/index.php?title=Plasmidi&oldid=20243150”