Genomiselain
Siirry navigaatioon
Siirry hakuun
Genomiselain (engl. genome browser) on graafinen käyttöliittymä, jolla visualisoidaan genomitietoa. Toisen sukupolven sekvensointimenetelmien kehittymisen myötä genomien sekvensointi lisääntyi ja genomitiedon määrä lähti kasvuun. Genomiselaimet kehitettiin helpottamaan tietokantoihin tallennetun suuren tietomäärän käsittelyä. Ne voivat olla yhdelle lajille spesifisiä tai niillä voidaan visualisoida monen lajin perimä.[1] Suosituimpia verkkopohjaisia genomiselaimia ovat Ensembl ja UCSC.[2]
Lähteet[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]
- ↑ Jun Wang, Lei Kong, Ge Gao, Jingchu Luo: A brief introduction to web-based genome browsers. Briefings in Bioinformatics, 2013, 14. vsk, nro 2, s. 131–143. Oxford University Press. doi:10.1093/bib/bbs029. (englanniksi)
- ↑ Medina, Ignacio ym: Genome Maps, a new generation genome browser. Nucleic Acids Research, 2013, 41. vsk, s. W41–W46. PubMed:23748955. doi:10.1093/nar/gkt530. (englanniksi)