Sytokromi c

Wikipedia

Ohjattu sivulta Sytokromi-c
Loikkaa: valikkoon, hakuun
 Tämän artikkelin tai sen osan kieliasua on pyydetty parannettavaksi.
Voit auttaa Wikipediaa parantamalla artikkelin kieliasua.
Tarkennus: Kirjoitusvirheet, yleinen kieliasu
Sytokromi c, hemi merkitty punaisella.

Sytokromi c (cyt c) on kaikissa tai lähes kaikissa soluissa esiintyvä pieni hemiproteiini. Sytokromi c:ssä on melko lyhyt aminohapoista koostuva peptidiketju ja hemi. Hemi on rautaporfyriini, joka toimii niin sanottuna prosteettisena ryhmänä.

Sytokromi c:n peptidiosan massa on yli 12 000 daltonia ja koostuu noin sadasta aminohaposta. Sytokromi c on hyvin veteen liukeneva toisin kuin muut sytokromit. Pisimmän tunnetun sytokromi c:n pituus on 113 aminohappoa eli 339 emäsparia. Vehnän sytokromi c:ssä 112 aminohappoa ja ihmisen sytokromi-c:ssä 104 aminohappoa[1].

Sytokromi c:n hemiosan rauta-atomin hapetustila voi muuttua Fe2+ \leftrightarrow Fe3+, joten se voi osallistua solun hapetus-pelkistysreaktioihin elektroninsiirtäjänä. Sytokromi c on solulle tyypillisen elektroninsiirtoketjun osa. Se on keskeisessä roolissa solun aerobisessa metaboliassa (soluhengitys) solun mitokondrion hengitysketjun yhtenä komponenttina, jossa se siirtää elektroneja kompleksista III kompleksiin IV. Tästä elektronit siirtyvät hapelle, joka yhtyessään vedyn kanssa muodostaa vettä.

[muokkaa] Sytokromi c:n diversiteetti ja evoluutio

Sytokromi-c voi olla eri eliöillä hyvinkin erilainen[2][3]. Ihmisen ja simpanssin sytokromi c:t ovat identtisiä. Reesusmakakin ja ihmisen välillä on vain yhden aminohapon ero. Myös kanalla ja kalkkunalla on identtiset sytokromi c:t.[4]

Tutkijoiden mukaan sytokromi c olisi muuntunut evoluutiossa vauhdilla 4-10 aminohappoa vuotta kohden[5]. Suunnilleen nykyisen 104 aminohapon pituinen sytokromi c alkoi olla tonnikalasta alkaen[6].

Alla on lueteltu joitain eri lajien sytokromi-c:n aminohappojärjestyksiä. Aminohapot merkitään kirjainlyhenteillä.[7][8]

ihminen --------mgdvekgkkifimkcsqchtvekg------gkhktgpnlhglfgrktgqapgysytaan---knkgiiwgedtlmeylenpkkyipg--------tkmifvgikkkeeradliaylkkatne
simpanssi --------mgdvekgkkifimkcsqchtvekg------gkhktgpnlhglfgrktgqapgysytaan---knkgiiwgedtlmeylenpkkyipg--------tkmifvgikkkeeradliaylkkatne
hiiri --------mgdvekgkkifvqkcaqchtvekg------gkhktgpnlhglfgrktgqaagfsytdan---knkgitwgedtlmeylenpkkyipg--------tkmifagikkkgeradliaylkkatne
rotta --------mgdvekgkkifvqkcaqchtvekg------gkhktgpnlhglfgrktgqaagfsytdan---knkgitwgedtlmeylenpkkyipg--------tkmifagikkkgeradliaylkkatne
sika ---------gdvekgkkifvqkcaqchtvekg------gkhktgpnlhglfgrktgqapgfsytdan---knkgitwgeetlmeylenpkkyipg--------tkmifagikkkgeredliaylkkatne
kana --------mgdiekgkkifvqkcsqchtvekg------gkhktgpnlhglfgrktgqaegfsytdan---knkgitwgedtlmeylenpkkyipg--------tkmifagikkkservdliaylkdatsk
alligaattori ---------gdvekgkkifvqkcaqchtvekg------gkhktgpnlhgligrktgqapgfsytean---knkgitwgeetlmeylenpkkyipg--------tkmifagikkkperadliaylkeatsn
kalkkarokäärme ---------gdvekgkkifsmkcgtchtveeg------gkhktgpnlhglfgrktgqavgysytaan---knkgiiwgddtlmeylenpkkyipg--------tkmvftglkskkertdliaylkeatak
härkäsammakko ---------gdvekgkkifvqkcaqchtcekg------gkhkvgpnlygligrktgqaagfsytdan---knkgitwgedtlmeylenpkkyipg--------tkm-fagikkkgerqdliaylksacsk
tonnikala ---------gdvakgkktfvqkcaqchtveng------gkhkvgpnlwglfgrktgqaegysytdan---kskgivwnentlmeylenpkkyipg--------tkmifagikkkgerqdlvaylksats-
banaanikärpänen ----mgvpagdvekgkklfvqrcaqchtveag------gkhkvgpnlhgligrktgqaagfaytdan---kakgitwnedtlfeylenpkkyipg--------tkmifaglkkpnergdliaylksatk-
hiiva akestgfkpgsakkgatlfktrcqqchtieeg------gpnkvgpnlhgifgrhsgqvkgysytdan---inknvkwdedsmseyltnpkkyipg--------tkmafaglkkekdrndlitymtkaak-
maissi asfs-eappgnpkagekifktkcaqchtvekg------aghkqgpnlnglfgrqsgttagysysaan---knkavvweentlydyllnpkkyipg--------tkmvfpglkkpqeradliaylkeata-
auringonkukka a-sfaeapagdpttgakifktkcaqchtvekg------aghkqgpnlnglfgrqsgttagysysaan---knmaviweentlydyllnpkkyipg--------tkmvfpglkkpqeradliaylktsta-
Rhodospirillum rubrum --------egdaaagekvsk-kclachtfdqg------gankvgpnlfgvfentaahkdnyaysesytemkakgltwteanlaayvknpkafvleksgdpkakskmtfk-ltkddeienviaylktl---
Rhodobacter capsulatus ---------gdaakgekefn-kcktchsiiapdgteivkgaktgpnlygvvgrtagtypefkykdsivalgasgfawteediatyvkdpgaflkeklddkkaktgmafk-lakgge--dvaaylasvvk-

[muokkaa] Viitteet

  1. ↑ Juhani Lokki, Anssi Saura, P.M.A. Tigerstedt, Evoluutio ja populaatiot, WSOY Porvoo 1986, ISBN 951-0-13572,
  2. ↑ http://www.sigmaaldrich.com/life-science/metabolomics/enzyme-explorer/learning-center/cytochrome-c.html tochrome C
  3. ↑ http://members.cox.net/ardipithecus/evol/seq.html
  4. ↑ Stone, Linda & Lurquin, Paul F. & Cavalli-Sforza, Luigi Luca: Genes, Culture, and Human Evolution: A Synthesis, s. 79. Wiley-Blackwell, 2007. ISBN 1405150890. Teoksen verkkoversio (viitattu 18.6.2009).
  5. ↑ Lokki, Evoluutio ja populaatiot, sivu 257
  6. ↑ Evoluutio ja populaatiot, sivu 260
  7. ↑ http://members.cox.net/ardipithecus/evol/seq.html Some Cytochrome C Sequences -
  8. ↑ http://alpha2.bmc.uu.se/Courses/Bke1/Labs/bioinfo2_lab.html KE0026 Biochemistry Labs Computer lab: Bioinformatics 2 - Understanding protein 3D structure Introduction
Haettu osoitteesta http://fi.wikipedia.org/wiki/Sytokromi_c
Henkilökohtaiset työkalut