Ero sivun ”Tymiini-DNA-glykosylaasi” versioiden välillä
| [katsottu versio] | [katsottu versio] |
pEi muokkausyhteenvetoa |
Ei muokkausyhteenvetoa |
||
| Rivi 1: | Rivi 1: | ||
[[Kuva:Protein TDG PDB 1wyw.png|thumb|250px|Malli ihmisen tymiini-DNA-glykosylaasin rakenteesta]] |
[[Kuva:Protein TDG PDB 1wyw.png|thumb|250px|Malli ihmisen tymiini-DNA-glykosylaasin rakenteesta]] |
||
'''Tymiini-DNA-glykosylaasi''' on [[hydrolaasit|hydrolaaseihin]] kuuluva [[entsyymi]]. Se on [[glykosylaasit|glykosylaasi]] ja katalysoi virheellisten [[nukleosidi]]en glykosidisidoksen hydrolyysiä. Näin entsyymi osallistuu DNA:n virheiden korjaamiseen. Tymiini-DNA-glykosylaasia esiintyy aitotumaisissa eliöissä, arkeissa sekä eräissä bakteereissa kuten ''[[ |
'''Tymiini-DNA-glykosylaasi''' on [[hydrolaasit|hydrolaaseihin]] kuuluva [[entsyymi]]. Se on [[glykosylaasit|glykosylaasi]] ja katalysoi virheellisten [[nukleosidi]]en glykosidisidoksen hydrolyysiä. Näin entsyymi osallistuu DNA:n virheiden korjaamiseen. Tymiini-DNA-glykosylaasia esiintyy aitotumaisissa eliöissä, arkeissa sekä eräissä bakteereissa kuten ''[[Escherischia coli]]''-bakteerissa. Tymiini-DNA-glykosylaasin [[EC-numero]] on EC 3.2.2.29.<ref name="brenda">{{Verkkoviite | Osoite =http://brenda-enzymes.org/enzyme.php?ecno=3.2.2.29 | Nimeke =EC 3.2.2.29 - thymine-DNA glycosylase | Julkaisija =Brenda | Viitattu =12.3.2017 | Kieli = {{en}}}}</ref><ref name="encyclopedia">{{Kirjaviite | Tekijä =William J. Lennarz,M. Daniel Lane | Nimeke =Encyclopedia of Biological Chemistry | Vuosi =2013 | Sivu =78 |Julkaisija =Elsevier | Tunniste =ISBN 9780123786302 | www =https://books.google.fi/books?id=ykUu06JQrjcC&pg=PA78&dq=Thymine-DNA+glycosylase&hl=fi&sa=X&redir_esc=y#v=onepage&q=Thymine-DNA%20glycosylase&f=false | www-teksti =Kirja Googlen teoshaussa | Viitattu =12.3.2017 | Kieli ={{en}}}}</ref> |
||
==Toiminta== |
==Toiminta== |
||
Versio 13. maaliskuuta 2017 kello 12.52
Tymiini-DNA-glykosylaasi on hydrolaaseihin kuuluva entsyymi. Se on glykosylaasi ja katalysoi virheellisten nukleosidien glykosidisidoksen hydrolyysiä. Näin entsyymi osallistuu DNA:n virheiden korjaamiseen. Tymiini-DNA-glykosylaasia esiintyy aitotumaisissa eliöissä, arkeissa sekä eräissä bakteereissa kuten Escherischia coli-bakteerissa. Tymiini-DNA-glykosylaasin EC-numero on EC 3.2.2.29.[1][2]
Toiminta
Tymiini-DNA-glykosylaasi havaitsee virheellisiä emäspareja DNA:ssa ja hajottaa emäksen ja DNA:n välisen glykosidisen sidoksen. Ensimmäinen virheellinen emäspari, jonka entsyymin havaittiin hajottavan, on pari tymiinin ja guanosiinin välillä, josta entsyymi irrottaa tymiinin. Tämä aktiivisuus on kuitenkin heikompaa ja hitaampaa verrattuna muihin vastaavankaltaisiin entsyymeihin. Myöhemmin tymiini-DNA-glykosylaatin on havaittu olevan aktiivinen myös urasiilin erottamisessa virheellisestä urasiilin ja guanosiinin pareista. Muita harvinaisempia virheellisiä nukleosidejä, joita entsyymi erottaa DNA:sta ovat 5-metyylisytosiini, etenosytosiini, 5-hydroksimetyyliurasiili ja etenoguanosiini. Tymiini-DNA-glykosylaasi sitoutuu erotetun nukleosidin tilalle, kunnes eräs eksonukleaaseihin kuuluva entsyymi irrottaa sen ja DNA-polymeraasi- ja DNA-replikaasientyymit pääsevät lisäämään oikean nukleosidin virheellisen tilalle.[1][2][3][4][5]
Lähteet
- ↑ a b EC 3.2.2.29 - thymine-DNA glycosylase Brenda. Viitattu 12.3.2017. (englanniksi)
- ↑ a b William J. Lennarz,M. Daniel Lane: Encyclopedia of Biological Chemistry, s. 78. Elsevier, 2013. ISBN 9780123786302. Kirja Googlen teoshaussa (viitattu 12.3.2017). (englanniksi)
- ↑ Wolfram Siede,Paul W. Doetsch: DNA Damage Recognition, s. 375. CRC Press, 2005. ISBN 9780849352683. Kirja Googlen teoshaussa (viitattu 12.3.2017). (englanniksi)
- ↑ Karsten Rippe: Genome Organization And Function In The Cell Nucleus, s. 39. John Wiley & Sons, 2012. ISBN 978-3-527-64000-3. Kirja Googlen teoshaussa (viitattu 12.3.2017). (englanniksi)
- ↑ Ralph Bradshaw Philip Stahl: Encyclopedia of Cell Biology, s. 444. Academic Press, 2015. ISBN 9780123947963. Kirja Googlen teoshaussa (viitattu 12.3.2017). (englanniksi)