Sigmafaktori

Sigmafaktori on prokaryoottien DNA:n transkriptioon liittyvä tekijä. Sigmafaktoreita on monta erilaista, ja niistä jokainen kasvattaa RNA polymeraasin spesifisyyttä tietyn geenin promoottorille, kun faktori on sitoutunut RNA polymeraasi -entsyymiin. Entsyymistä käytetään tällöin yleisnimitystä holoentsyymi. Kun $\sigma$-faktoria ei ole kiinnittynyt RNA polymeraasiin, se voi sitoutua mihin tahansa DNA-templaatilla. $\sigma$-faktorilla se kiinnittyy erityisesti faktorin saneleman geenin promootteriin ja transkriptio alkaa.

$\sigma$-faktoreiden käyttö mahdollistaa prokaryootin (kuten bakteerin) adaptaation ympäristöllisiin muutoksiin. N. 90% bakteriaalisesta DNA:sta liittyy näihin muutoksiin vastaamiseen. Erilaisten $\sigma$-faktoreiden kirjo mahdollistaa näiden geenien reguloidun ekspression. Näiden geenien koodaamat proteiinit toteuttavat itse vastauksen ärsykkeisiin.

Bakteeri Escherichia coli käyttää seitsemää $\sigma$-faktoria:

• σ⁷⁰ (RpoD) - yleinen sigmafaktori, liittyy kasvavien solujen tarvitsemien geenien ekspressioon.
• σ³⁸ (RpoS) - ravinnon puutteeseen liittyvä sigmafaktori
• σ²⁸ (RpoF) - flagellumin (kts. bakteerimoottori) toimintaan liittyvä sigmafaktori
• σ³² (RpoH) - ulkoiseen lämpöshokkiin liittyvä sigmafaktori
• σ²⁴ (RpoE) - ulkoiseen voimaan liittyvä sigmafaktori
• σ⁵⁴ (RpoN) - typen puutteeseen liittyvä sigmafaktori
• σ¹⁹ (FecI) - Fe(III) sitraattiin liittyvä sigmafaktori