Pyrimidiini
Wikipedia
Pyrimidiini on tyypillisimmillään DNA:ssa ja RNA:ssa esiintyvä typpipitoinen rengasmainen emäs. Pyrimidiini on yhden heterosyklisen 6-renkaan sisältävä orgaaninen yhdiste C4H4N2, jonka emäsjohdokset (pyrimiidiemäkset) ovat rakenneosana nukleosideissa, nukleotideissa ja nukleiinihapoissa.
Nukleiinihapoissa pyrimidiinejä on kolmea tyyppiä: sytosiini (C), tymiini (T) ja urasiili (U). Urasiili esiintyy vain RNA:ssa ja tymiini vain DNA:ssa. Sytosiinia on sekä DNA:ssa että RNA.ssa. DNA:n kaksoiskierre syntyy pyrimidiiniemästen liittyessä vetysidoksin puriiniemäksiin. Sytosiini liittyy vetysidoksella guaniiniin, tymiini ja urasiili taas adeniiniin. Emäkset ovat kiinnittyneet DNA:n tai RNA:n sokeriosan ykköshiileen.
On myös muita pyrimidiinejä, jotka eivät esiinny nukleiinihapoissa. Alla pyrimidiinien peruskaava eri tavoin esitettynä.
Tiamiini (B1-vitamiini) on pyrimidiinijohdos.
[muokkaa] Pyrimidiinen biosynteesistä
Pyrimidiinin soluissa tapahtuva biosynteesi vaatii, niin kuin puriinien biosynteesi, PPriboosiP:tä, glutamiinia, hiilidioksidia ja aspartaattia sekä tetrahydrofolaatin johdannaisia. CPT ja TMP jotka sisältävät sytosiinia ja tymiiniä, tuotetaan soluissa 9 askeleen reaktioketjussa, joka haarautuu UDP:n kohdalla.
Alkukohta on ATP, glutamiini ja hiilidioksidi CO2. Entsyymi tuottaa niistä CAP:ta ja asparagiinihappoa. Näistä edelleen CAA:ta, DHOA:aa, OA:ta, OMP:ta, UMP:ta ja UDP:tä. Dihydroottisen hapon DHOA:n muuttaminen oroottiseksi hapoksi OA:ksi vaatii entsyymin lisäksi NAD+:aa. OA:n muunto OMP:ksi vaatii PP-Riboosi-P:tä. UDP muutetaan edelleen UTP:ksi ja entsyymin, ATP:n ja glutamiinin avulla CTP:ksi. Toinen haara tuottaa entsyymin avulla UDP:stä dUDP:tä. dUMp:tä ja lopulta N5,N10-metyleeni H4-folaatin kautta H2-folaattia ja TMP:tä. Reektioketjut tarvitsevat yhdeksää entsyymiä[1].
[muokkaa] Katso myös
[muokkaa] Viitteet
- ↑ Harper's Biochemistry, 16. edition, 1981,ISBN 0-87041-036-9, sivut 340-341, mm Fig. 26-15 sivulla 341
| Nukleiinihapot ja oligonukleotidit muokkaa | ||
|---|---|---|
| Emäkset: | Adeniini | Tymiini | Urasiili | Guaniini | Sytosiini | Puriini | Pyrimidiini | |
| Nukleosidit: | Adenosiini | Uridiini | Guanosiini | Sytidiini | Deoksiadenosiini | Tymidiini | Deoksiguanosiini | Deoksisytidiini | |
| Nukleotidit: | AMP | UMP | GMP | CMP | ADP | UDP | GDP | CDP | ATP | UTP | GTP | CTP | cAMP | cADPR | cGMP | |
| Deoksinukleotidit: | dAMP | TMP | dGMP | dCMP | dADP | TDP | dGDP | dCDP | dATP | TTP | dGTP | dCTP | |
| Ribonukleiiniihapot: | RNA | mRNA | tRNA | rRNA | ncRNA | sgRNA | shRNA | siRNA | snRNA | miRNA | snoRNA | LNA | |
| Deoksiribonukleiinihapot: | DNA | mtDNA | cDNA | plasmidi | kosmidi | BAC | YAC | HAC | |
| Nukleiinihappojen analogit: | GNA | PNA | TNA | morpholino | |
