Prätkähiiret tulevat Maahan ja huomaavat, että plutolaiset ovat alkaneet siirtää maata Lalli Leipäjuuston johdolla pois planeetalta. Hiiret saavat apua naismekaanikolta Santulta estääkseen Maata kokemasta samaa kohtaloa kuin Mars.
Leipäjuusto kidnappaa Chicagon pormestarin ja syyttää prätkähiiriä rikoksesta. Nimitettyään itsensä toimeenpanevaksi pormestariksi ja Rasvanahan poliisipäälliköksi, ryhtyy hän toteuttamaan suunnitelmaansa ryöstää koko Chicago, kun Prätkähiiret taistelevat toisaalla erään superroiston kanssa.
Prätkähiiret karkaavat ja huomaavat, että Leipäjuusto on rakentanut jättimäisen kaivinkoneen kaivamaan maan koko Chicagon alta. Prätkähiirten täytyy muuntaa moottoripyöränsä maanalaiseen käyttöön sopiviksi, jotta voisivat taistella Leipäjuustoa ja hänen uutta roistoa Tunnelirottaa vastaan.
Leipäjuusto palkkaa pahanhajuiset plutolaisroistot Pyttylän veljekset auttamaan taistelussa Prätkähiiriä vastaan. Veljekset epäonnistuvat, mutta kieltäytyvät lähtemästä Maasta koska he pitävät roskaruoasta, mikä saa heidän kehonsa löyhkäämään sietämättömästi ja Leipäjuusto keksii loistoidean. Hän karkottaisi Chicagon asukkaat pois kaupungistaan pahanhajuisten veljesten avulla ja ostaisi sitten halvalla kaupungin.
Moton ollessa peitettynä myrkyllisen aineen jäljiltä Leipäjuusto karkaa paikalta vieden samalla Moton prätkän. Eikä Moto rauhoitu ennen kuin Santtu, Turbo ja Vinski pelastavat hänen prätkänsä.
Leipäjuusto palkkaa Sädesilmän ja hänen apulaisensa Hölön ja Hiipparin, rikkomaan Prätkähiirten yhteishengen, jotta he saisivat napata hiiret yksitellen.
Prätkähiiret saavat huomata ettei Leipäjuusto ole ainut konna Chicagossa, kun he yrittävät pysäyttää pankkiryöstön. Turbo ja Moto lähtevät roistojen perään joiden matka päättyy monttuun. Siellä hiiret joutuvat Monttupomon vangiksi ja saavat huomata pahimmat ja ilkeimmät rikolliset joita he eivät ole ennen nähneet. Vinskin täytyy nyt lähteä kohti monttua pelastamaan "veljensä".
Moto ja Vinski loukkaantuvat, kun he yrittävät pysäyttää uuden jengin, jotka varastavat polttoainetta. Tehtävä jää Turbolle, jonka täytyy mennä valeasussa Santun kanssa pysäyttämään Katukorppien suunnitelmat.
Prätkähiirten inhoama Hevi-Hemmo saapuu Chicagoon, mutta tällä kertaa uudella asenteella. Suomenkielisessä dubbauksessa Hevi-Hemmon ääni parodioi Andy McCoyta.
