Lähetti-RNA

Lähetti-RNA eli lRNA eli mRNA (engl. messenger RNA) on RNA-ketju, joka syntyy solun tumassa transkriptioksi kutsutussa tapahtumassa DNA:n emäsjärjestyksen ohjaamana. Lähetti-RNA sisältää geneettisen informaation, joka voidaan kääntää (translaatiossa) proteiinien aminohappojärjestykseksi. Tätä tapahtumaketjua (DNA->RNA->proteiini) kutsutaan molekyylibiologian keskeisdogmaksi.

Kuten DNA:ssa, lähetti-RNA:n geneettinen informaatio on koodattuna nukleotidien ketjuiksi (sekvensseiksi). Ketjun nukleotidit muodostavat kodoneita jotka muodostuvat kolmesta nukleotidista. Kukin kodoni koodaa spesifistä aminohappoa lukuunottamatta stop-kodonia, joka päättää proteiinisynteesin (geneettinen koodi). Kodonien translaatio aminohappoketjuksi vaatii kahta muuta RNA-tyyppiä: siirtäjä-RNA:ta (tRNA) ja ribosomaalista RNA:ta (rRNA).

Sisältö

• Synteesi, prosessointi ja funktio
  • Transkriptio
  • Eukaryoottien pre-mRNA prosessointi
    • 5'-cap rakenne
    • Silmikointi
    • Editointi
    • Polyadenylointi

• Rakenne
  • 5'-cap
  • Koodaava alue
  • Ei-koodaavat alueet (UTR)
  • Poly(A)-häntä
  • Monocistroninen ja polycistroninen RNA
  • mRNA:n rengastuminen

• Hajoitus
  • Prokaryoottien mRNA hajotus
  • Eukaryoottien mRNA hajotus
  • AU-rikkaiden alueiden hajotus
  • Non-sense välitteinen hajotus
  • small interfering RNA:t
  • microRNA:t
  • Muut hajotustavat

• Lähteet
• Linkit

Eukaryoottisoluissa lähetti-RNA:ta muokataan kolmella tavalla ennen kuin se pääsee kulkemaan tumasta sytoplasmaan. Ensimmäisenä lähetti-RNA:n 5'-päähän liitetään GTP, johon on liittynyt metyyliryhmä. Lisäksi lähetti-RNA:n 3'-päähän liitetään useita ATP-molekyylejä. Päiden muokkaus suojaa lähetti-RNA:ta pilkkovilta entsyymeiltä sekä ne auttavat solua tunnistamaan lähetti-RNA:n. Eukaryoottisolujen DNA:ssa on eksoneita ja introneita. Intronit poistetaan silmukoinnilla ennen lähetti-RNA:n poistumista tumasta. Prokaryottisoluissa ei ole tumaa ja niiden DNA:ssa ei ole introneita eli sytoplasmaan syntyvää lähetti-RNA:ta voidaan käyttää sellaisenaan translaatiossa. Lisäksi prokaryoottisoluissa transkriptio ja translaatio voivat tapahtua samanaikaisesti. Kun eukaryoottisolujen lähetti-RNA sisältää vain yhden proteiinin translaation ohjeen, prokaryoottisolujen lähetti-RNA voi sisältää useamman proteiinin translaation ohjeen.

Lähteet

Nukleiinihapot ja niiden rakenneosat

Nukleosidien rakenneosat	Emäkset Puriinit: Adeniini • Guaniini Pyrimidiinit: Tymiini • Urasiili • Sytosiini Sokerit Riboosi • Deoksiriboosi
Nukleiinihappojen rakenneosat	Nukleosidit Adenosiini • Uridiini • Guanosiini • Sytidiini • Deoksiadenosiini • Tymidiini • Deoksiguanosiini • Deoksisytidiini Nukleotidit AMP • UMP • GMP • CMP • ADP • UDP • GDP • CDP • ATP • UTP • GTP • CTP • cAMP • cADPR • cGMP Deoksiribonukleotidit dAMP • dUMP • TMP • dGMP • dCMP • dADP • TDP • dGDP • dCDP • dATP • TTP • dGTP • dCTP
Nukleiinihapot	Ribonukleiinihapot RNA • mRNA • tRNA • rRNA • ncRNA • sgRNA • shRNA • siRNA • snRNA • miRNA • snoRNA • LNA Deoksiribonukleiinihapot DNA • mtDNA • cDNA • plasmidi • kosmidi • BAC • YAC • HAC Nukleiinihappojen analogit GNA • PNA • TNA • morpholino