Haploryhmä

Wikipedia
Loikkaa: valikkoon, hakuun

Haploryhmä on keskenään lähisukuisten DNA:n haplotyyppien joukko tai tietyn geenin tai genominosan kehityslinja tietyn lajin sisällä. Haploryhmien taajuudet usein vaihtelevat maantieteellisesti lajin esiintymisalueen eri osissa. Erityisesti ihmisillä eri mantereiden ja eri etnisten ryhmien haplotyyppikoostumus vaihtelee, ja tämä vaihtelu on syntynyt ihmisen levittäytyessä maapallolle alkukodistaan. Haplotyyppien esiintymisestä ja jakaumasta voidaan jäljittää yksilöiden etnistä alkuperää ja populaatioiden tai kansojen historiaa. Tähän perustuu paljolti geneettinen sukututkimus.

Termi haplotyyppi ja haploryhmä voi periaatteessa viitata mihin tahansa DNA- tai kromosomialueeseen. Käytännössä haploryhmiä on ihmisellä tutkittu lähinnä mitokondrion DNA:sta ja Y-kromosomista, jotka molemmat periytyvät vain toiselta vanhemmalta jälkeläisille haploidina, niin ettei niissä tapahdu rekombinaatiota. Siksi niiden polveutumishistoria on varsin helppo määrittää.

Mitokondrio-DNA periytyy maternaalisesti, äidiltä lapsille, ja sisältää informaatiota vain äitilinjan historiasta. Y-kromosomi puolestaan periytyy isältä pojalle, ja kertoo paternaalisesta historiasta. Kaikkien ihmisen mitokondrioiden kantamuotoon on kirjallisuudessa yleensä viitattu raamatullisella nimellä Eeva, ja Y-kromosomien kantamuotoon nimellä Aatami.

Ihmisen mitokondrio-DNA-haploryhmät[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]

Eri kansoilla on tyypilliset ja toisistaan poikkeavat haploryhmien osuudet. Eurooppalaisessa väestössä tyypillisiä mtDNA-haploryhmiä on kymmenkunta.

Ihmiskunnan äitilinjan haplotyypit ja oletetut väestöjen muinaiset muutot.
Ihmislajin vaellus Afrikan alkukodista haploryhmämittausten mukaan, toinen esitys.
Ihmisen mitokondrio-DNA-haploryhmien polveutumiskaavio
  mtDNA:n kantaäiti    
L0   L1  
L2 L3  
  M N  
M1 CZ D E G Q   A I W X   R   N1 N2 Y
C Z B F JT P   U  
J T K pre-HV
HV
H V

Eri mitokondrio-DNA-haploryhmien nykyisiä tyypillisimpiä esiintymisalueita ja kansoja:[1]

  • A Koillis-Siperian tshuktshit jne, Pohjois-Amerikan/Grönlannin eskimot, na denet ja myös monet amerind-kielet
  • B Taiwanin alkuasukkaat, myös Etelä-Kiinaa, Indonesia ja Polynesia sekä Uusi-Seelanti
  • C Pohjois-Siperia: evenki, burjaatti, altailainen, jakuutti
  • D Itä-Aasian mongolit, Hazn-kiinalaiset, burjaatit, borneolaiset, Pohjois-Amerikan aleutit, jotkut Etelä-Amerikan intiaanit
  • E Borneo
  • G Koillis-Siperia, mm. itelmeenit
  • H Eurooppa, Pohjois-Afrikka, Länsi-Aasia
  • L1 Eteläinen ja keskinen Afrikka
  • L2 Länsi-Afrikka
  • L3 Itä-Afrikka
  • M Etelä-Aasian intialaiset, pakistanilaiset
  • N Australian aboriginaalit
  • R Thaimaa
  • Q Uusi-Guinea
  • U Pohjois-Skandinavia, mm. saamelaiset, Lähi-Itä mm. kurdit, Länsi-Aasia, mm. altailaiset ja turkkilaiset

Theodore Scurrin mukaan ihmisen mitokondrio-dna:n tyypit A, B, C ja D ovat iältään 60 000-50 000 vuotta, ja X noin 35 000 vuotta.[2]

Ihmisen Y-kromosomin haploryhmät[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]

Varhaisin miesten Y-kromosomin haploryhmä oli haploryhmä A. Tätä esiintyy yhä Afrikan khoisaneilla, etiopialaisilla ja nilooteilla. Haploryhmä A:ta pidetään yli 50 000 vuotta vanhana. Euroopan väestössä on melko nuoria haploryhmiä, jotka ovat kehittyneet Afrikan ulkopuolella. Theodore Scurrin mukaan Y-kromosomin C- ja D-ryhmät syntyivät 50 000 vuotta sitten, K ja P 40000 vuotta sitten, ja Q 20 000-15 000 vuotta sitten.[2]

Y-kromosomin haploryhmien jakaumaa Euroopassa
Y-kromosomin O-haploryhmän esiintyminen on painottunut Kiinaan
Ihmisen Y-kromosomin DNA:n (Y-DNA:n) haploryhmät
Y-yhteinen esi-isä
|
A |
B |
C DE F
D E G H IJ K
I J L M NO P
N O Q R
Y-DNAn haploryhmät mtDNAn haploryhmät Alue / ihmiset
A L0, L1 Etelä-Afrikka, khoisan
B L2 Pygmit ja vastaavat
E1, E2, E3a L3 Saharan eteläpuolinen Afrikka, bantut
NO/N/O CZ/C/Z, D, G (M types) Itä-Aasia, Siperia
K, M (M9-positiivinen, M45-negatiivinen) R, P (N-tyypit), Q (M-tyyppi) ja Tyynenmeren alueen M-aliklaaneja Tyynenmeren alue
R, I, J HV/H/V, JT/J/T, U/K (N-tyypit) Eurooppa, Länsi-Aasia
Q A, X, Y (N-tyypit), C, D (M-tyypit) Itä-Siperia, Amerikka

lähde?

Lähteet[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]

  1. Kalevi Wiik: Mistä suomalaiset ovat tulleet?, sivu 127
  2. a b Keitä olivat ensimmäiset amerikkalaiset, Amerikan asutushistoria mureni käsiin. Tiede 7/2007, sivut 35-42

Aiheesta muualla[muokkaa | muokkaa wikitekstiä]